Каньон входит в территорию Чарынского национального парка, образованного 23 февраля 2004 года.

Чарынский каньон – памятник природы, сложенный из осадочных пород, возраст которых составляет около 12 миллионов лет. Высота отвесных гор каньона достигает 150-300 м.

Наиболее интересным местом для туристов является так называемая Долина за́мков, длина которой составляет около 2 км, ширина – 20-80 м.

В лоне каньона сохранилась роща реликтового вида ясеня, пережившего эпоху оледенения – ясеня согдийского. Другая подобная роща есть только в Северной Америке. С 1964 года Ясеневая роща объявлена Памятником природы. Также огромный интерес представляет и туранговая роща – роща азиатского тополя.

Здесь произрастает более 1500 видов растений, 17 из которых занесены в Красную книгу Казахстана и 62 вида млекопитающих, 103 вида гнездящихся птиц, 25 видов рептилий.

В верхней части Чарынского каньона можно увидеть снежных грифов, кумаев. Почти все обитающие здесь крупные хищные птицы относятся к охраняемым видам и внесены в Красную Книгу Казахстана, а орёл-бородач внесён и в Красные Книги многих других стран.

Бородачами этих орлов назвали из-за своеобразных пучков перьев, растущих по бокам головы, и напоминающих бороду. Это – одна из наиболее крупных хищных птиц, обитающих в здешних горах. Размах крыльев этой удивительной птицы может достигать трёх метров, а вес – от 7 до 10 килограммов. Когда бородач летит, его оперение издаёт громкий, присущий только этим птицам, свист.

В предгорьях юго-восточной части Казахстана в зимнее время можно встретить довольно много пернатых хищников: это ястребы, белохвостые орланы, курганники, зимняки, орлы-ягнятники (бородачи), гималайские грифы (кумаи), соколы-балобаны, шахины, кречеты. В тёплые зимы можно видеть коршунов.

Наиболее распространённые хищные птицы, часто встречающиеся зимой в предгорьях Заилийского Алатау – курганники. Они много лет гнездятся в Чарынском каньоне, а иногда и зимуют. С севера на зимовку прилетают хищные птицы, которых так и называют зимняки, второе их название – мохноногие канюки. Эти птицы – обитатели северной части Евразии. От своих южных собратьев они отличаются по цвету и по характеру оперения. Лапы у них покрыты перьями почти до самых пальцев, что предохраняет их от обморожения. Ближе к крупным рекам, зимой можно встретить белохвостых орланов, иногда, в холодные зимы, они даже могут прилетать к окраинам больших посёлков.

В летнее время левый берег реки Чарын, а точнее, участок каньона, известный как «Долина замков», посещают туристы. Здесь можно встретить и парижских студентов, путешествующих автостопом, и немецких туристов, идущих пешком с Иссык-Куля через Кульсайские озёра. Но правый берег реки, где расположены Красный Каньон, и каньон Темирлика, до последнего времени остаётся экзотикой. Чтобы добраться до Красного Каньона или до каньона Темирлика, нужно пересечь Чарын и ещё 30-40 километров ехать по степной дороге